バイオインフォマティクス

大規模フィンガープリント類似検索のための簡潔マルチビット木の実装を公開しました

以前のブログで紹介した簡潔マルチビット木のc++による実装 (Succinct Multibit Tree (SMBT)) を公開致しました。ソフトウェアーはgoogle codeからダウンロードすることができます。 http://code.google.com/p/smbt/SMBTは去年のWABIで発表した内容にもとづ…

MLAB2012で大規模化合物フィンガープリントの類似度検索のための簡潔データ構造に関する研究発表を行いました

8月6日,7日に北海道大学で開催された、機械学習とバイオインフォマティクスのワークショップMLAB2012にて研究発表を行いました。 http://www.cris.hokudai.ac.jp/takigawa/mlab2012/発表内容は大規模化合物フィンガープリントデータベースのための新しい簡潔…